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除了计算力和能量支持，材料也是一个关键因素。可编程原子不可能无中生有的产生物质，所以它需要材料。但是，因为已经可以进行原子级别的重组，所以可编程原子理论上可以组成任何化合物结构，但是却无法改变原子结构。也就是说，可编程原子无法用铁原子合成黄金，但只要再提供别的辅助原子，它就可以组成任何一种合金结构。
因为这种特点，可编程原子修复船体需要转换一定量的外界物质。当然，新星号因为有这种功能，所以会额外带上一些材料作为备用，但是如果备用材料耗尽，也不是说就没办法了。可编程原子其实可以分解任何物质，只要停在某个星球表面，或者小行星，它们就可以像是行军蚁蚕食大型生物一样分解掉星体表面的物质并选出有用的元素加以转化。
只要以上三点条件都能正常运作，那么新星号就可以无限再生，不管损伤程度多高都一样。而且损伤越小，修复越快。
目前新星号内部的八个龙族成员都在，能量也算够用，而且穿体内的备用修复物质还没有用完，所以修复速度相当快，这一路打过来也不过就不到半小时而已，那个洞口就已经只剩下一个可以过私家车的小洞了。算上洞口变小之后恢复加快的部分，剩下的部分应该可以在十几分钟之内完全恢复。
当然，新恢复的位置强度会比别的地方弱一点。倒不是恢复材料的问题，而是因为修补原理的问题。可编程原子在修复过程中会先编织出类似金属网一样的东西，然后编织第二层网格，逐渐向前堆积，最后组成分子级的网孔结构封堵漏洞修复原有结构。在这个网眼结构完成后，功能其实就已经基本恢复了，而且肉眼看不出任何的问题。但这个时候材料本身内部其实全都是洞，所以结构强度其实达不到原先的标准，但至少能用了。
在这一步紧急补充修理完成之后，可编程原子才会开始一点点的往网格的缝隙之中填充材料并完全封堵缺口，只有等到这一部做完，材料强度才会恢复之前的水平。不过这种时候外面的防御依然不会达到原来的标准，因为可编程原子恢复的部分只有船体结构和内部的设备，而新星号外面的防护装甲则是一层真正的生物装甲。
这层金闪闪的生物装甲就是一种真真的生命体了，和船体本身没有任何生物意识的可编程原子不一样，这层生命体有类似于软体动物级别的思维能力。它是活的，有生命，可以对外部刺激做出一定的反应。虽然智力水平几乎等于没有，但这毕竟是生命体。
这个生物装甲虽然看起来金光闪闪，好像是金属，但其实它却是一种真正的生命体，只不过它属于混合生命体，不能简单的认为是硅基生命或者碳基生命，它是一种人造的独立生命体系。
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